Miután az UEFA jelenlegi első alelnöke, a spanyol Ángel María Villar egy hete visszalépett, a szlovén szövetséget 2011 óta irányító, 48 éves jogász egyetlen ellenfele a holland szövetség elnöke, Michael van Praag volt. A szavazáson 42-13-ra győzött Ceferin, akinek megbízatása 2019 tavaszáig szól.
Elnökválasztásra azért volt szükség, mert a nemzetközi szövetség etikai biztossága decemberben Michel Platini alelnököt, az UEFA első számú vezetőjét "összeférhetetlenség" és "hűtlen kezelés" miatt eltiltotta a labdarúgással kapcsolatos mindennemű tevékenységtől. A francia sportvezető májusban - miután a nemzetközi Sportdöntőbíróság nem mentette fel őt, hanem csak hatról négy évre csökkentette eltiltását - szóban lemondott posztjáról. Később jelezte, hogy mindezt Athénban hivatalosan is megteszi majd, amihez megkapta a jóváhagyást a FIFA etikai bizottságától, és szerdán el is búcsúzott.
Ceferin az UEFA hetedik megválasztott elnöke.
Az UEFA elnökei:
Ebbe Schwartz (dán) - 1954. június 22. - 1962. április 17.
Gustav Wiederkehr (svájci) - 1962. április 17. - 1972. július 7.
Barcs Sándor (magyar, megbízott elnök)- 1972. július 7. - 1973. március 15.
Artemio Franchi (olasz) - 1973. március 15. - 1983. augusztus 12.
Jacques Georges (francia) - 1983. augusztus 12. - 1990. április 19.
Lennart Johansson (svéd) - 1990. április 19. - 2007. január 26.
Michel Platini (francia) - 2007. január 26. - 2015. október 8.
Ángel María Villar (spanyol, ügyvezető elnök) - 2015. október 8. - 2016. szeptember 14.
Aleksander Ceferin (szlovén) - 2016. szeptember 14. -