A felújítás december 9-től február 3-ig tartó szakaszában számos vonat módosított menetrend szerint közlekedik. A későbbi munkafázisokhoz igazodva további módosítások is lesznek a felújítás teljes befejezéséig.
- A miskolci, kassai, nyíregyházi és debreceni InterCity vonatok a Keleti pályaudvarról 5 perccel korábban indulnak, minden óra 25. percében.
- A sátoraljaújhelyi sebes és egri gyorsvonatok a Keleti pályaudvarról minden óra 55. percében indulnak.
- A hatvani személyvonatok a Keleti pályaudvarról 5 perccel korábban indulnak. A Hatvanból a Keletibe induló személyvonatok egy része 3 perccel korábban közlekedik.
- A gödöllői személyvonatok utasait Isaszeg–Gödöllő állomások között pótlóbuszok szállítják.
- A hatvani vonal vágányzári menetrendje miatt a Budapest–Vác–Szob, Aszód–Balassagyarmat, továbbá a Budapest–Újszász–Szolnok vonalakon egyes vonatok módosított menetrend szerint közlekednek.