Az iskola negyvennégy év kényszerű szünet után 1992-ben alakult újra, eleinte a Hunyadi utcán működött, utána költözött a Városház téri épületbe, ami azonban nem a Fráter eredeti épülete, hiszen az az iskola 1948-as államosításáig a mai Földes Ferenc Gimnázium épületében működött (sőt, a régi Fráter és a régi Lévay 1952-ben történt összevonásával alakult ki a mai Földes).
Az oktatás tehát 1992 szeptemberében a Szatmári Irgalmas Nővérek Hunyadi u. 6. szám alatti épületében indult el, majd az 1992/93-as tanév végeztével a Városház tér 6. szám alatti ingatlan - amely 1948-ig az Érseki Leánynevelő Intézetnek adott otthont - teljes egészében visszakerült a Szatmári Irgalmas Nővérek tulajdonába, így ezt követően ott folytatta működését a Fráter. Az iskolát az elmúlt húsz évben teljesen felújították, és új, oktatási funkciójú szárnyakkal is bővítették.
